تقوم الهيئة بإعداد شكاوى متعلقة بانتهاكات لحقوق فلسطينيين من قبل الإحتلال الإسرائيلي، وإستخدام آليات الأمم المتحدة المتاحة لتقديم تلك الشكاوى بعد إستيفاء كافة الشروط المطلوبة.

كما تعمل الهيئة على إستقبال شكاوى فردية حول إنتهاكات حقوق الإنسان لمتابعتها وفق آليات الأمم المتحدة، كما يفترض من الهيئة أن توفر الدعم القانوني والحقوقي للمقرر الخاص بالأراض الفلسطينية المحتلة.

ومن المتوقع أن تعمد الهيئة إلى اللجوء إلى القانون الدولي الجنائي لمتابعة إنتهاكات لحقوق الإنسان تصل إلى مرتبة جرائم الحرب.